东京召开首脑会议，地点是东京湾的新设施「Edge of Ocean」。这是一座，会议举办的5月1日当天，将动用2万2千人警方人员的超巨大设施。然而不料某天，竟发生了突如其来的大规模爆炸事件！其中，出现了可以掌控全国公安警察的警察厅秘密组织——通称「ZERO」组织的成员安室透的身影。为何不在会议当天，而选择在会议之前引爆呢？以及安室背地里诡异的行为，让柯南感到事情蹊跷不已。这时，现场证物上留下的指纹，竟然与过去所属警视厅的毛利小五郎的指纹相吻合！其中到底有什么阴谋？围绕逮捕小五郎，柯南和安室展开了交战。安室透这个谜一般的存在，究竟是敌是友？「极秘任务」的倒计时，此时已经无声无息地开始了——
演员：小野坂昌也,青木沙耶香,吉野裕行,宫本充,小林沙苗,藤原启治,阪口大助,小林优,森田成一,广桥凉,千叶进步,太田哲治,有本钦隆,菅生隆之,中田和宏,伊藤美纪,后藤沙绪里,神田朱未,子安武人,三宅健太,山口胜平,大林隆介,若本规夫,井上麻里奈,羽多野涉,伊丸冈笃,永泽菜教,平野俊隆,古泽彻,楠大典,斋藤千和,伊藤静,神奈延年,大畑伸太郎,高垣彩阳,斧笃,长克巳,塚田正昭,速水奖,河本邦弘,浪川大辅,成田剑,小伏伸之,西村知道,杉田智和
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